Fingenious® - ikkuna suomalaisiin biopankkiaineistoihin ja biolääketieteelliseen tutkimukseen
Fingenious®-palvelu tarjoaa pääsyn suomalaisiin biopankkiaineistoihin, ja sen kautta ovat saumattomasti saatavilla Suomen julkisten biopankkien asiantuntijapalvelut, näytteet ja data sekä tutkittavat erilaisiin biolääketieteellisiin tutkimuksiin. Palvelun tarkoituksena on edistää biolääketieteellistä tutkimusta palvellen akateemisia ja yritysten tutkijoita kansallisesti ja kansainvälisesti.
Yhden luukun palvelu akateemisille ja yritysten tutkijoille
Fingenious-palvelu tarjoaa tutkijoille yhden luukun palvelua esiselvityksissä, näyte- ja tietoluovutuksissa, tutkimuksen koordinoinnissa sekä sopimuspalveluissa. Palvelu tekee tutkimusten tekemisestä sujuvampaa. Kauttamme ei saa vain dataa tai näytteitä, vaan autamme myös oikeiden kumppanien valinnassa.
- Fingenious®-palvelu tarjoaa ennen kaikkea vaivattoman näkymän ja pääsyn Suomen julkisiin biopankkiaineistoihin.
- Palvelu tarjoaa mahdollisuuden yhdistää erilaisia aineistoja: sen avulla on mahdollista löytää juuri kyseiseen tutkimukseen sopiva tutkittava ainutlaatuisen takaisinkutsupalvelun avulla.
- Fingenious®-palvelu säästää tutkijoiden aikaa ja resursseja automatisoimalla ja standardisoimalla haut suomalaisten biopankkien datasta. Palvelumme avulla aineistojen etsiminen ja kokoaminen nopeutuvat.
Rekisteröidy palveluun osoitteessa www.fingenious.fi.
FINBB tarjoaa Fingenious®-palvelun tutkijoille. Biopankkien Osuuskunta Suomi – FINBB luo kanavaa ihmisen hyvinvoinnin ja terveyden ymmärtämiseen rakentamalla Suomeen maailman parasta biopankkiverkostoa. FINBB:n omistajia ovat suomalaiset yliopistot, Suomen kuusi suurinta sairaanhoitopiiriä sekä Terveyden ja hyvinvoinnin laitos (THL).
Keski-Suomen Biopankin näyteluovutusprosessi
1. Esiselvityspyyntö
Rekisteröidy Fingenious®-palveluun osoitteessa www.fingenious.fi ja tee esiselvityspyyntö, jossa kuvaat tutkimushankkeesi ja kysymysten asettelun. Biopankki selvittää, onko sopivia näytteitä/tietoja saatavilla. Samalla voidaan tehdä kustannusarvio.
2. Näyte- ja tietoluovutuspyyntö
Esiselvityspyynnön jälkeen voit tehdä varsinaisen näyte-ja tietoluovutuspyynnön samassa Fingenious®-palvelussa. Ohjeet pyynnön tekemiseen löytyvät palvelusta. Lomakkeen huolellinen täyttö nopeuttaa pyyntösi käsittelyä. Voit ottaa myös yhteyttä biopankkiin osoitteessa biopankki(at)hyvaks.fi. Pyynnön saapumisen jälkeen biopankki tai FINBB (jos pyyntö kohdistuu useampaan biopankkiin) tarkastaa pyynnön ja pyytää mahdollisesti lisäyksiä tai korjauksia. Kun pyyntö on kunnossa, se viedään tieteellisen ohjausryhmän arvioitavaksi.
3. Biopankin tieteellisen ohjausryhmän käsittely
Tieteellinen ohjausryhmä arvioi saapuneen hakemuksen ja antaa käsittelyn jälkeen lausunnon aineiston luovuttamisesta. Luovutuspäätös toimitetaan tutkijalle kirjallisena.
4. Tutkimusaineiston luovutus
Myönteisen päätöksen jälkeen tutkimusaineiston luovutuksesta laaditaan kirjallinen luovutussopimus (MTA, Material Transfer Agreement). Sopimus tehdään tutkijan taustaorganisaation kanssa. Käytännön asioista ja aikatauluista sovitaan jokaisen tutkijan kanssa erikseen. Tutkimusaineisto luovutetaan tutkijalle sopimuksen allekirjoittamisen jälkeen.
5. Tulosten palautus
Tutkimuksen päätyttyä aineistokohtaiset tulokset palautetaan biopankkiin. Palautuva data kasvattaa biopankin näytekokoelman tutkimuksellista arvoa.
6. Mahdolliset jatkotutkimuspyynnöt
Biopankin välityksellä voit pyytää yksittäisiä näytteenantajia jatkotutkimuksiin.
Keski-Suomen Biopankin tieteellinen ohjausryhmä
Biopankin toimintaa varten on perustettu ohjausryhmä, johon Keski-Suomen hyvinvointialue (Hyvaks) ja Jyväskylän yliopisto (JYU) valitsevat edustajansa. Hyvinvointialueen edustajat nimittää hyvinvointialueen sairaalapalveluiden johtaja ja yliopiston jäsenet yliopiston rehtori.
Tieteellinen ohjausryhmä arvioi saapuneen hakemuksen.
Ohjausryhmä arvioi:
- kuuluuko tutkimus biopankin tutkimusalueeseen
- tutkimuksen tieteellisen tason, merkittävyyden ja eettisyyden
- pyydetyn aineiston koon suhteessa biopankin näytemääriin
Ohjausryhmä kokoontuu joka toinen kuukausi ja tarvittaessa useammin.
Ohjausryhmän varsinaiset jäsenet
- Lassi Hirvonen - ohjausryhmän puheenjohtaja, Hyvaks palvelupäällikkö
- Kati Kinnunen - Hyvaks johtajaylilääkäri
- Kirsi Timonen - Hyvaks ylilääkäri
- Jari Laukkanen - Hyvaks osastonylilääkäri/professori
- Sari Lindeman - Hyvaks osastonylilääkäri/professori
- Lotta-Riina Sundberg - JYU professori
- Jan Kujala - JYU professori
- Elina Sillanpää - JYU apulaisprofessori
- Eija Laakkonen - JYU apulaisprofessori, ohjausryhmän varapuheenjohtaja
Ohjausryhmän varajäsenet
- Varpu Marjomäki - JYU professori
- Juha Hulmi - JYU professori
- Riikka Kivelä - JYU professori
Vakituiset asiantuntijajäsenet
- Tiina Jokela - Hyvaks/JYU tutkimusjohtaja, biopankista vastaava henkilö
- Maarit Ahtiainen, Keski-Suomen Biopankki, tutkimusasiantuntija
- Tomi Lilja, Keski-Suomen Biopankki, teknologia-asiantuntija
- Veera Avelin, Keski-Suomen Biopankki, tuotantopäällikkö, ohjausryhmän sihteeri
Usein kysytyt kysymykset
Keski-Suomen Biopankin näytekokoelmaan kuuluu kokoverta, plasmaa, FFPE-kudosnäytteitä, tuorekudosnäytteitä ja ctDNA-plasmaa syöpäpotilailta sekä likvori- ja pariseeruminäytteitä. Seeruminäytteiden keräys laajenee syksyn 2026 aikana, kun EDTA-verinäytteen rinnalla aletaan kerätä myös seerumiverinäyte.
Ajantasaiset tiedot näytemääristä löydät täältä: Biopankin aineistot.
Koko Suomen biopankkien näytekokoelmia pääset tarkastelemaan osoitteessa www.fingenious.fi. Saatavilla olevat näytetyypit vaihtelevat biopankeittain.
Nyrkkisääntö on, että jos data on hyvinvointialueen potilastietojärjestelmässä, se on yleensä käytettävissä biopankkitutkimuksiin. Tämä tarkoittaa monenlaista terveyteen liittyvää tietoa, kuten diagnooseja sekä tutkimustuloksia ja -tallenteita. Lisäksi biopankkitutkimuksista palautuu tietoa biopankkiin. Keski-Suomen Biopankissa on saatavilla yli 13 000 henkilön genomidata.
Tutkijalla on mahdollisuus yhdistää biopankista saatavia tietoja julkisten rekisterien, kuten Tilastokeskuksen tai Syöpärekisterin, tietoihin. Jos tutkija haluaa yhdistää tietoa useammalta kuin kahdelta rekisterinpitäjältä, tietojen yhdistämisen tekee Findata.
Näytteisiin yhdistettävistä tiedoista ja tietolähteistä on tarkempi listaus rekisteriselosteessa. Voit myös tiedustella tiedon saatavuutta biopankista, jos tutkimuksessasi halutaan käyttää sellaista tietoa, jota ei tässä ole mainittu.
Uuden näytekeräyksen aloittamisesta sovitaan erikseen biopankin kanssa. Biopankin kautta on myös mahdollista rekrytoida tutkittavia tutkimuksen puitteissa tapahtuvaa lisätiedon tai -näytteiden keräämistä varten (esim. kyselylomake, kuvantaminen, interventiotutkimus tai näytteenotto). Kutsun voi kohdistaa haluttuun ihmisryhmään esimerkiksi iän ja diagnoosinumeron perusteella. Sähköisten kyselyiden toteuttamiseen on käytettävissä OmaBiopankki -alusta, jonka kautta biopankkisuostumuksen antaneet henkilöt voivat täyttää kyselylomakkeita niin, että vastaukset ovat yhdistettävissä biopankin näytteisiin ja tietoihin, mutta henkilötunnukset ja nimet eivät tule tutkijan tietoon.
Biopankin EDTA-verinäytteet otetaan huoneenlämmössä ja säilytetään käsittelyyn asti +4 asteessa. Näytteet jaetaan neljään 260 µl:n kokoveri- ja plasma-alierään, joiden lyhytaikainen säilytys tapahtuu −20 ja −80 asteessa ja pitkäaikainen −196 asteessa. Biopankki voi tarvittaessa toimittaa tutkijalle näytekäsittelyviiveeseen liittyviä aikaleimoja tai valita tutkimukseen soveltuvat näytteet tiettyjen kriteerien perusteella (esim. haluttu pakasteviive).
Biopankki voi tarvittaessa valmistaa veri- ja muista näytteistä jatkotuotteita, kuten genomista DNA:ta kokoverestä tai TMA-blokkeja FFPE-näytteistä. Myös näytelasien digitointi on mahdollista.
Hinnasta sovitaan tutkimuskohtaisesti. Biopankit eivät tavoittele voittoa, mutta syntyvät kulut laskutetaan. Esimerkiksi tutkimussuunnitelman ja tarvittavien liitteiden kattavuus, haettavien näytteiden ja tietojen määrä ja laatu, hakukriteereiden monimutkaisuus ja tarvittava näytteiden käsittely biopankissa vaikuttavat merkittävästi lopulliseen hintaan. Biopankki voi antaa tutkimukselle kustannusarvion, jos sille toimitetaan tarkka kuvaus tutkimuksesta, sen budjetista sekä tutkimukseen vaadittavista tiedoista ja näytteistä. Alla olevat esimerkit on tarkoitettu antamaan viitteellinen kuva kustannuksista, ja kustannukset voivat poiketa alla olevista esimerkeistä.
Esimerkki yksinkertaisesta luovutuksesta: keskimäärin 3000–7000 e
Tutkimussuunnitelma ja tarvittavat liitteet saapuvat biopankille kattavina ja huolellisesti täytettyinä. Tutkimushankkeessa luovutetaan joitakin kymmeniä kudos- tai verinäytteitä sekä näihin liittyvää kliinistä tietoa. Tieto on rakenteista, eikä sen hakemiseen potilasteksteistä tarvita kliinikkoa. Näytteet luovutetaan esimerkiksi värjäämättöminä laseille leikattuina leikkeinä tai verinäytteet kokoverialaerinä. Suurin osa biopankissa toteutuneista akateemisista tutkimuksista osuu tähän hintaluokkaan.
Esimerkki monimutkaisesta luovutuksesta: keskimäärin 13 000–20 000 e
Tutkimukselle eristetään DNA:ta tai valmistetaan monikudosblokkeja (TMA), joista leikataan leikkeitä. Tutkimuksessa vaadittava tieto on osittain rakenteista, mutta osa tiedoista vaatii biopankin kliinikon läpikäyntiä potilasteksteistä tutkittava kerrallaan. Kliinikko käyttää tietojen hakemiseen yhden työpäivän. Tutkittavia on joitakin kymmeniä.
Ennen varsinaista näytteiden ja tietojen luovutussopimusta on selvitettävä, onko biopankissa saatavilla soveltuvia näytteitä. Tämä tehdään Suomen biopankkien yhteisen portaalin Fingeniouksen kautta. Yksinkertaiset selvitykset ovat maksuttomia, mutta myös selvitysvaiheessa voi syntyä kuluja selvityksen monimutkaisuudesta riippuen (ks. Fingeniouksen hinnasto).
Eettisen toimikunnan lausunto ei yleensä ole tutkimukselle pakollinen, jos tutkimuksessa käytetään olemassa olevia näytteitä ja tietoja (esim. kudosnäytteet tai biopankissa olevat verinäytteet ja niihin liittyvät tiedot). Tutkijan on kuitenkin tässäkin tapauksessa sisällytettävä hakemukseensa omaa eettistä pohdintaa. Pohdinta kirjataan Fingeniouksessa sille varattuun kohtaan luovutuspyyntölomakkeella tai lisätään luovutuspyynnön liitteeksi. Esimerkiksi odottamattomien kliinisten löydösten, kuten tutkimuksessa selvinnyt uusi tieto riskigeenistä, merkitystä ja aiheuttamia toimenpiteitä tulee arvioida.
Tutkimuskohtaiset seikat saattavat kuitenkin vaatia tutkimuksen käsittelyä eettisessä toimikunnassa. Biopankin ohjausryhmä voi tarvittaessa pyytää tutkijaa toimittamaan eettisen toimikunnan lausunnon tutkimuksesta ennen kuin antaa tutkimuksesta lausuntonsa. Tarkempaa tietoa siitä, milloin tutkimukselle on tehtävä eettinen ennakkoarviointi, löydät Jyväskylän yliopiston ihmistieteiden eettisen toimikunnan ja Tutkimuseettisen neuvottelukunnan (TENK) sivuilta.
Tutkimukseen liittyvistä henkilöstö- tai muista muutoksista tulee aina ilmoittaa biopankille ja sopia erikseen. Myös biopankilla on ilmoitusvelvollisuus tutkimuskohorttiin liittyvistä muutoksista, kuten näyte- tai tietoluovutuksen jälkeen tulleesta biopankkikiellosta. Kiellosta ilmoitetaan tutkijalle, eikä näytettä tai siihen liittyviä tietoja saa enää sen jälkeen käyttää tutkimuksessa.